#!/bin/bash -l
#$ -S /bin/bash
#$ -l h_rt=01:00:0
#$ -l mem=2G
#$ -l tmpfs=15G
#$ -N md_0_1
#$ -pe mpi 12
#$ -cwd 


module -f unload compilers mpi gcc-libs
module load beta-modules
module load gcc-libs/7.3.0
module load compilers/intel/2020/release
module load mpi/intel/2019/update6/intel
module load gromacs/2020.4/intel-2020

FILE=md_0_1.cpt

if test -f "$FILE"
then
   gerun mdrun_mpi -v -deffnm md_0_1 -cpi -append -maxh 1
else
   gerun mdrun_mpi -v -deffnm md_0_1 -maxh 1
fi